Depuis 2012, le Pôle-relais lagunes méditerranéennes participe en collaboration avec le Museum National d’Histoire Naturelle, à l’élaboration d’une méthodologie d’évaluation de l’état de conservation concernant l’habitat naturel prioritaire 1150-2* « Lagunes côtières méditerranéennes ». L’objectif est de servir d’appui au rapport national de l’état de conservation des habitats naturels d’intérêt communautaire au sens de la Directive Habitats Faune Flore. Après une première année de développement ayant mené au choix de 12 indicateurs, ce rapport présente les résultats du test opérationnel effectué en 2013 pour sa mise en application par les gestionnaires de sites Natura 2000. Un échantillonnage sur 22 lagunes des régions Languedoc-Roussillon et Provence-Alpes-Côte-D’azur a permis la confrontation des résultats des indicateurs retenus en 2012 avec les avis d’experts locaux. Les analyses de ces résultats ont ensuite été discutées en groupe de travail, réunissant experts scientifiques, gestionnaires de site et représentants de l’État, afin de proposer les modifications nécessaires à la mise en application de la méthode. Les modifications proposées concernent le poids accordé à chaque indicateur dans l’évaluation globale ainsi que les paramètres mesurés pour chaque indicateur. Le test a également permis une évaluation de la faisabilité des relevés de terrain pour la rédaction d’un guide d’application de la méthode. Ce travail d’harmonisation de l’évaluation de l’état des lagunes de la façade méditerranéenne est le premier du genre sur ces milieux et constituera, en plus d’une aide au rendu national, un outil au niveau local pour évaluer l’impact des mesures de gestion appliquées.