Projet Méta-IBD - Indice biologique diatomées : évaluation de la mise en routine de la méthode de metabarcoding à l'échelle locale (Sud-ouest de la France)

Meta-IBD est un projet de recherche appliquée, financé par l'Agence de l'Eau Adour Garonne et mené par les Laboratoires des Pyrénées et des Landes, laboratoire de mesure et d'analyses (chef de file), Artemis, bureau d'études spécialiste en phycologie (études des algues), et Scimabio Interface, notamment spécialisée dans les approches ADN diatomées et le transfert opérationnel. D'une durée de 2 ans, l'objectif est d'évaluer, sur la base d'un test grandeur nature à l'échelle locale, si la méthode de metabarcoding développée sur les IBD par INRAE est fonctionnelle en conditions de routine, par comparaison avec les résultats obtenus avec la méthode de référence (microscopie). Plus précisément, les actions visaient à : Etablir les listes taxonomiques de diatomées sur le bassin Adour Garonne par méthode de référence ; Comparer ces listes à celles obtenues par metabarcoding par utilisation de la base de référence Diat.Barcode, et à en évaluer l'impact sur les indices IBD ; Comparer les résultats de calculs de classes de qualité obtenus avec les deux méthodes ; Evaluer si la méthode complète est fonctionnelle en conditions de routine.