Typage d'une population de bactéries du genre Vibrio associé à un élevage de crevettes pénéides

Ce rapport fait état d'une étude réalisée au laboratoire de Génétique et Pathologie de l'IFREMER dàns le cadre de l'analyse d'épisodes de mot1alité anormale survenue en écloserie privée de crevettes pénéides. Plusieurs hypothèses ont été avancées. La présence de Vibrio harveyi a amené à constituer une collection de 40 souches à pat1ir desquelles une identification bactériologique a été effectuée. Elle montre en effet une dominance de souches appartenant à un groupe homogène de Vibrio harveyi. La technique de ribotypage (digestion d'ADN génomique, transfert de Southern-blot et hybridation avec une sonde spécifique) est alors mise en place. Plusieurs difficultés techniques ont ralenti l'analyse et n'ont donc pas permis d'avoir des résultats assez avancés pour résoudre le problème de la mortalité. Cependant cette technique a montré son intérêt pour le typage des souches impliquées dans les épisodes de mortalité. Il est ainsi apparue qu'une même espèce pouvait être divisée en sous-groupes qui pourraient ne pas avoir le même pouvoir pathogène. L'étude préliminaire réalisée durant ce stage a donc été positive même s'il reste au laboratoire à optimiser la technique pour l'utiliser en routine.