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TNPC software - Traitement Numérique des Pièces Calcifiées / Numerical Treatment of Calcified Structures : Développement d’un logiciel dédié à l’analyse des pièces calcifiées :
Titre alternatif
Producteur
Contributeur(s)
Éditeur(s)
Colloque de Sclérochronologie : Structures dures ou calcifiées chez les organismes aquatiques : leur utilisation en écologie halieutique, 2-4 Juillet 2013, Rennes
Identifiant documentaire
9-25905
Identifiant OAI
oai:archimer.ifremer.fr:25905
Auteur(s):
Fave, Sébastien,Crepin, Emeline,Magalhaes, José Ramos,Ogor, Andre,De Pontual, Helene,Mahe, Kelig
Mots clés
Date de publication
01/01/2013
Date de création
Date de modification
Date d'acceptation du document
Date de dépôt légal
Langue
fre
Thème
Type de ressource
Source
Droits de réutilisation
info:eu-repo/semantics/openAccess
Région
Département
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Description
Chaque année, près d’1 million de pièces calcifiées (dont 35 000 en France) sont analysées pour l’évaluation de l’état des ressources marines. De plus, beaucoup de thématiques de recherche nécessitent elles-aussi l’utilisation de ces pièces calcifiées. Ainsi, depuis plus de 20 ans, un partenariat entre la société VSG (Visualization Sciences Group anciennement Noesis) et l’institut de recherche IFREMER (Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer) a permis de développer le logiciel d'analyse d'images dédié aux pièces calcifiées, nommé TNPC (Traitement Numérique des Pièces Calcifiées, www.tnpc.fr). Divers projets de recherche et collaborations en particulier avec l’ENIB (Ecole Nationale des Ingénieurs de Brest) ont été nécessaires pour finaliser ce logiciel. Il a été conçu et développé à l’origine par le laboratoire de Sclérochronologie des Animaux Aquatiques de l’IFREMER de Brest. Ce logiciel permet une assistance à la quantification et à l’interprétation des pièces calcifiées, un stockage numérique de matériel biologique pouvant se dégrader avec le temps, une facilité d’échange des données entraînant une meilleur qualification de l’estimation d’âge et enfin une diminution des coûts avec des processus d’automatisation. Ce logiciel développé au départ pour les poissons est aussi utilisé actuellement pour d’autres animaux comme les céphalopodes ou les mollusques. Il possède de nombreuses fonctions : acquisition d’images individuelles et en série, annotation en direct des images, interprétation et mesures, analyse de forme, base de données, estimation automatique de l’âge individuel ou de structures d’âge… En 2013, la version 7 du logiciel intégrée à la plate-forme Visilog 7 est disponible.
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