Synthèse bibliographique de la composition floristique phytoplanctonique en milieux estuariens - Convention 2010 - Action 1

Les milieux estuariens sont à l’interface entre des eaux douces provenant des cours d’eau et des eaux salées issues du milieu marin. Ce sont donc des environnements extrêmement variables au niveau des paramètres hydrologiques et physico-chimiques. Ces facteurs influencent directement la biocénose. Le phytoplancton est particulièrement sensible à ces variations (Smayda, 1997). La production primaire est à la base des écosystèmes en tant que premier maillon du réseau trophique. Elle est influencée par différents facteurs tels que l’irradiance, la disponibilité en nutriments, la température, la turbulence, le mélange des eaux et la turbidité du milieu. C’est le phytoplancton qui est responsable en eaux libres de cette production primaire. La structure des communautés phytoplanctoniques peut être caractérisée de différentes façons : les espèces qui la composent, leur abondance et la biomasse. La Directive Cadre sur l’Eau (DCE) préconise l’utilisation de ce compartiment biologique comme indicateur de la qualité des milieux aquatiques. L’indicateur phytoplancton est composé de trois indices : la biomasse, l’abondance et la composition. L’indice composition à été définit provisoirement au niveau français mais ne donne pas satisfaction. Car les estuaires sont plutôt considérés comme des zones d'accumulation temporaire du phytoplancton venue du bassin versant amont, et non pas des zones de production interne, étant donné les fortes turbidités. C’est pourquoi dans le cadre d’une convention entre l’ONEMA, l’Ifremer et le CNRS, il a été décidé de réaliser une synthèse bibliographique de la composition phytoplanctonique en milieu estuarien, ceci afin d’avoir une vue globale de la dynamique de ce compartiment sur les estuaires tempérés. Cette synthèse sera une aide pour la redéfinition d’un indice représentatif de la composition taxonomique du phytoplancton, et qui reflète autant que possible l’évolution de la qualité des masses d’eau.