Programme National d'Océanographie Cotière (P.N.O.C) Volet "microbiologie sanitaire". Synthèse des travaux

INTRODUCTION Problématique générale Les zones marines côtières reçoivent des rejets d'eaux urbaines et agricoles qui contiennent de grandes quantités de micro-organismes dont certains sont pathogènes pour l'homme (par ex. virus de l'hépatite A. ..). Dans les environnements hostiles, la dispersion et conditions de survie défavorables (énergies lumineuse importante, eau oligotrophe...) font que les bactéries disparaissent rapidement ou évoluent vers un état non cultivable. Par contre, certains milieux comme les sédiments, les eaux turbides ou eutrophisées, présentent des conditions favorables à la survie des bactéries d'origine entérique et à la protection physique des particules virales. Dans les écosystèmes perturbés de nombreux apports anthropiques, la présence notamment de matière organique assimilable et de composés osmo-protecteurs peut permettre à la flore bactérienne allochtone ou entérique de s'implanter. Le devenir des micro-organismes d'origine continentale dans écosystèmes soumis a ces présente théoriquement deux aspects : (i) une disparition à plus ou moins brève échéance ou tout au moins une dérive vers un état de dormance et (ii) une colonisation temporaire tout ou partie compartiments de l'écosystème.