Programme national d'océanographie côtière (P.N.O.C.), volet "Microbiologie sanitaire", résumé des activités et des travaux

Les zones marines littorales reçoivent des rejets d'eaux usées d'origine urbaine et agricole qui contiennent de très grandes quantités de micro-organismes dont certains sont pathogènes pour l'homme ; dans environnements hostiles, la dispersion et les conditions vie défavorables font que ces bactéries et virus disparaissent rapidement ou évoluent vers un état non cultivable. Cependant, certains milieux - sédiments, eaux turbides ou eutrophisées présentent favorables à la survie bactéries et à la protection des particules virales, Les travaux réalisés ces dernières ont apporté la preuve que bactéries sont capables de survivre dans l'environnement, d'adapter leur métabolisme aux conditions naturelles et sur très longues périodes ; dans ces conditions évoluent vers des états de dormance où ne sont plus cultivables ; ce constat attire les questions suivantes: Dans écosystèmes naturels, les bactéries d'origine entérique ont-elles encore une activité métabolique importante? La compétition avec la flore autochtone existe-t-elle ? Est-ce que leur pouvoir pathogène est maintenu? Enfin sont-elles capables d'échanger leur matériel génétique et modifier ainsi profondément la flore autochtone?