Première évaluation de la diversité des communautés microbiennes planctoniques au cours d'épisodes de mortalité des moules bleues en France : utilisation de l'approche de métabarcoding pour l'analyse de l'ADN environnemental

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Éditeur(s) Journées scientifiques et techniques Mer " (JST) : Journées de partage entre les experts de la biodiversité marine, AFB - Agence Française pour la Biodiversité. 11-12 juin 2019, Océanopolis Brest, France
Identifiant documentaire 9-61664
Identifiant OAI oai:archimer.ifremer.fr:61664
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Auteur(s): Pepin, Jean-francois,Bouget, Jean-francois,Chabirand, Jean-michel,Chasselin, Leo,Costes, Louis,Grizon, James,Lejolivet, Aurore,Le Noc, Sandrine,Palvadeau, Hubert,Schmitt, Anne,Seugnet, Jean-luc,Soletchnik, Patrick,Travers, Marie-agnes,Tourbiez, Delphine,Guesdon, Stephane
Mots clés MORBLEU Moules Mortalité ADN environnemental eDNA Metabarcoding Communautés microbiennes
Date de publication 01/01/2019
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Langue fre
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Since 2014 in France, in Charente maritime and Vendée, farmed and stocks of blue mussels experienced strong mortality events. In this context, the « MORBLEU » research project (DPMA-Ifremer agreement) was initiated to explore potentially aggravating factors, associated or correlated with mortality of mussels. Here, the work is to study biotic factors in mussels environment, looking for describe diversity and evolution of microbial communities (water column) before, during and after mortality events using NGS technology (metabarcoding) for environmental DNA analysis. We present, sampling strategy used from 2015 to 2018, Material & Methods and some preliminary results.  
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