MATUREAU : du code monolithique au package pour un clustering sur mesure applicable aux séries temporelles hydrogéologiques

La démarche MATUREAU, lancée en 2024 au BRGM, vise à renforcer l’accessibilité, d’abord interne, à des outils de traitement de données scientifiques liées à l’eau, par un effort de maturation de codes existants. Cette initiative se veut aussi une invitation adressée aux « hydro-développeurs » du BRGM, à adopter de meilleures pratiques de développement, notamment en termes de modularisation et packaging du code source, de standardisation des entrées-sorties, de proposition de chaînes de traitement de référence (workflows spécifiques à un cas d’étude, via des fonctions et/ou vignettes), de documentation, de tests fonctionnels pour assurer la maintenabilité des outils, … Plusieurs outils jugés prioritaires ont ainsi été sélectionnés et maturés, depuis 2024. L’outil présenté à ces Rencontres R est basé sur la notion de « clustering » appliquée à des séries temporelles. Le clustering par k-médoïdes est apparu comme une méthode statistique particulièrement efficace pour partitionner un grand nombre de chroniques piézométriques (de niveau d’eau souterraine) en un nombre relativement réduit de groupes (clusters), en utilisant une matrice de corrélations (entre une présélection des séries temporelles assez complètes à l’intérieur d’une période d’intérêt) comme mesure de dissimilarité, en entrée de l’algorithme PAM (Maechler et al., 2023). Dans cette présentation nous détaillerons l’approche suivie et montrerons comment la démarche MATUREAU, à travers la transformation d’un code d’origine monolithique en un package de fonctions faciles à enchaîner, a permis de gagner en interactivité, en reproductibilité et en pouvoir de généralisation.