Les inventaires généraux de la biodiversité en France et dans le monde

Un inventaire général de la biodiversité ou All Taxa Biodiversity Inventory (ATBI) est un processus d'inventaire coordonné de l'ensemble des espèces présentes dans un espace donné dont l’objectif est de faire progresser la connaissance taxonomique et chorologique et de mieux comprendre les communautés écologiques et leurs interactions au sein des écosystèmes. Il contribue, autant que possible, à une évaluation patrimoniale du territoire et à la mise en place de suivis. Ce rapport, à l’initiative du Muséum national d’Histoire naturelle, a pour objectif de dresser un état des lieux des inventaires généraux de la biodiversité en France et dans le monde et de fournir un retour d’expérience sur les initiatives les plus abouties. Il s’inscrit dans la continuité du diagnostic et des recommandations pour une stratégie d’acquisition de connaissances naturalistes continentales publiés par l’UMS PatriNat (AFB/CNRS/MNHN) à la demande du ministère en charge de l’environnement. Ce rapport participe également d’une volonté de nombreux acteurs d’aboutir à un document de cadrage et d’une réflexion sur un « label » des inventaires généraux de la biodiversité. Le but d’une telle démarche est dans un premier temps de fédérer, d’accompagner et de valoriser les expériences existantes. Mais il s’agit également d’encourager le développement de ces initiatives sur une série de sites de référence en prenant en compte une certaine représentativité notamment biogéographique et écosystémique, en intégrant des sites ruraux et urbanisés en métropole et en Outre-mer. Cette étude se base sur la consultation d’une soixantaine de documents (articles scientifiques, littérature grise, sites internet) et sur des échanges avec plusieurs dizaines d’experts impliqués dans des ATBI en France et dans le monde : taxonomistes, naturalistes, chargés de missions, techniciens, gestionnaires de données… Dans un premier temps, le document retrace la genèse des All Taxa Biodiversity Inventory dans les années 1990 sous l’impulsion de l’écologue nord-américain Daniel Janzen. Initialement prévu au Costa Rica le premier projet d’ATBI voit le jour en 1998 aux Etats-Unis dans le Parc national des Great Smoky Mountains. Les résultats de ce projet, toujours en cours, dépassent les espérances (19 254 espèces recensées dont 940 nouvelles pour la science) et inspirent une série de projets en Amérique du Nord (e.g. ATBI Adirondack, Boston Harbour Island) et à travers le monde. En Europe, l’ATBI transfrontalier du Mercantour-Alpi Marittime est à la fois le premier et le plus ambitieux dans ce domaine avec plus de 12 000 espèces inventoriées et plus d’une trentaine d’espèces nouvelles pour la science. D’autres projets, dans le cadre de l’European Distributed Institute of Taxonomy (EDIT), ont été initiés mais avec des résultats plus mitigés comme l’ATBI Gemer en Slovaquie (3 300 espèces identifiées dont 2 espèces nouvelles pour la science). À l’échelle de la France, il existe une réelle dynamique récente autour des inventaires généralisés de la biodiversité. Parmi les initiatives les plus abouties se trouvent le parc national du Mercantour (Alpes-Maritimes - Alpes-de-Haute-Provence), la Réserve intégrale du Lauvitel du Parc national des Écrins (Isère), la Réserve naturelle nationale de la Forêt de la Massane (Pyrénées-Orientales) et la forêt de Païolive et le plateau des Gras (Ardèche-Gard). D’autres inventaires ambitieux sont également présentés comme les îles Australes (Polynésie française), le site du bois de Bouis à Vidauban (Var), la faune marine du Parc national de la Guadeloupe ou Notre-Dame-des-Landes (Loire-Atlantique). Les inventaires généraux de la biodiversité sont par ailleurs contemporains du renouveau des grandes expéditions naturalistes comme « La Planète revisitée ». Les ambitions en termes de couverture taxonomique et de portée scientifique sont similaires, en revanche les durées des ATBI sont généralement supérieures ce qui permet une meilleure répartition de l’effort de prospection et plus de valorisations possibles en termes de gestion. Par ailleurs, les grandes expéditions naturalistes ciblent des sites à forte naturalité alors que les ATBI sont parfois menés à proximité de territoires fortement anthropisés. Le rapport présente également d’autres initiatives ayant comme objectif la connaissance exhaustive de la biodiversité à l’échelle nationale ou régionale comme le Swedish Taxonomy Initiative ou le Hawaii Biological Survey. Dans une seconde partie, un retour d’expérience est proposé dans le but d’approfondir les éléments les plus structurants d’un projet d’inventaire biologique général. Les thèmes abordés portent sur le choix du territoire, la superficie, le montage du projet (objectifs, durée, financement), son organisation (logistique, coordination, gouvernance), les stratégies d’inventaires et d’échantillonnage, la gestion des spécimens et leur détermination, la gestion et la diffusion des données et la valorisation des résultats (pour la recherche, pour la gestion de la zone d’étude et pour l’éducation). En conclusion, plusieurs points structurants sont mis en évidence dans la perspective d’un réseau français des inventaires généraux de la biodiversité.