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Le Plathelminthe terrestre Amaga expatria (Geoplanidae) en Guadeloupe et Martinique: nouveaux signalements et caractérisation moléculaire, dont le mitogénome complet
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Producteur
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Éditeur(s)
Identifiant documentaire
25-3011278
Identifiant OAI
3011278
Notice source
https://hal.science/hal-03009270v1
Auteur(s):
Justine Jean-Lou,Gey Delphine,Thévenot Jessica,Gastineau Romain,Jones Hugh D
Mots clés
Platyhelminthes
Invasive alien species
Caribbean
Mitogenome
Barcoding
Martinique
Guadeloupe
Geoplanidae
Date de publication
09/11/2020
Date de création
Date de modification
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Description
Contexte : Le Plathelminthe terrestre Amaga expatria Jones & Sterrer, 2005 (Geoplanidae) a été décrit à partir de deux spécimens collectés aux Bermudes en 1963 et 1988 et n'a pas été signalé depuis 2005. Méthodes : Grâce à un projet de science participative, nous avons reçu des observations sur le terrain, des photographies et des spécimens de la part de non-professionnels et de scientifiques locaux, en Martinique et en Guadeloupe. Nous avons barcodé des spécimens (COI) des deux îles et étudié l'histologie des organes reproducteurs d'un spécimen. Par séquençage de nouvelle génération, nous avons obtenu le mitogénome complet d'A. expatria et des informations sur ses proies à partir de l'ADN contaminant. Résultats : Nous rapportons des signalements de 2006 à 2019 dans deux îles françaises de l'arc caribéen, la Guadeloupe (six signalements) et la Martinique (14 signalements), à partir de photographies issues de la science participative et de spécimens examinés. Un spécimen de Martinique a été étudié pour l'histologie des organes copulateurs et a été barcodé pour le gène COI ; son anatomie était similaire à l'holotype, confirmant ainsi l'identification de l’espèce. Le gène COI était identique pour plusieurs spécimens de Martinique et de Guadeloupe et différait de plus de 10% des espèces les plus proches ; la caractérisation moléculaire de l'espèce est ainsi possible par des techniques classiques de codes-barres moléculaires. Le mitogénome a une longueur de 14962 pb et contient 12 gènes codant pour les protéines, deux gènes d'ARNr et 22 gènes d'ARNt ; pour deux gènes codants, il n'a pas été possible de déterminer le codon de départ. Le mitogénome a été comparé aux quelques mitogénomes disponibles des Geoplanidae et le plus similaire était Obama nungara, une espèce d'Amérique du Sud. Une analyse de l'ADN contaminant dans le système digestif suggère qu’A. expatria se nourrit de mollusques terrestres, et les observations de la science citoyenne sur le terrain suggèrent que ses proies comprennent des mollusques et des vers de terre ; l'espèce pourrait donc constituer une menace pour la biodiversité des animaux du sol dans les Caraïbes.
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