Dénombrement des Escherichia coli dans des sédiments de la baie de l'Aiguillon

Le rôle des sédiments dans la contamination du milieu marin en baie de l'Aiguillon est une des problématiques du laboratoire. Pendant quinze mois des dénombrements d'Escherichia coli dans des sédiments de la baie ont été effectués. Deux méthodes de numération ont été comparées: la technique NPP en tubes et la technique NPP en microplaque. En période printemps-été, la méthode NPP miniaturisée a conduit à des résultats sensiblement supérieurs à ceux obtenus par la méthode NPP en tubes. Cette différence pourrait s'expliquer par une fluorescence parasite du sédiment pendant cette période (éventuellement par du plancton; hypothèse non confirmée). Les concentrations en E.coli des sédiments sont variables au cours de l'année avec un niveau de contamination faible en période estivale et plus élevé en période hivernale. Les pics de pollution observés en hiver pourraient correspondre à des apports ponctuels des bassins versants. Les résultats montrent également une augmentation des concentrations en E.coli lorsque la salinité diminue (sans toutefois qu'une véritable corrélation ne soit mise en évidence).