Analyse du déterminisme génétique de la qualité de la viande de porc : une approche combinant génétique et génomique

La qualité des viandes est une caractéristique de première importance pour le consommateur ou pour l’industrie de transformation. Cependant, ces caractères (couleur, pH, pertes en eau. . . ) ne peuvent être mesurés que post-mortem sur des collatéraux des candidats à la sélection. Dans ces circonstances, l’identification de nouveaux prédicteurs facilement mesurables en routine sur les candidats à la sélection ou de marqueurs génétiques associés à la qualité des viandes devrait permettre d’améliorer la précision des évaluations génétiques et donc la réponse à la sélection. En se basant sur des données génétiques et génomiques, l’objectif des travaux présentés, visait à étudier le déterminisme génétique et les processus biologiques responsables de la variabilité de la qualité de la viande de porc et à fournir de nouveaux outils (prédicteurs biologiques, marqueurs génétiques) pour la sélection. L’analyse des transcriptomes des muscles longissimus dorsi et semimembranosus a mis en évidence une forte spécificité du transcriptome musculaire. Ces différences, liées à l’activité myogénique post-natal, peuvent avoir des conséquences sur la structure et le développement des tissus et in fine sur la qualité des viandes. Ces particularités doivent donc être prises en compte dans le cadre d’analyses visant à caractériser l’architecture génétique de la qualité des viandes et à identifier des marqueurs biologiques utilisable en sélection. L’analyse de la variabilité génétique de la quantité de transcrit dans le muscle longissimus a mis en évidence plusieurs transcrits fortement héritables et génétiquement corrélés aux caractères de qualités des viandes. De tels prédicteurs permettraient d’améliorer la précision des valeurs génétiques des candidats à la sélection et procureraient de ce fait un gain génétique plus rapide. Enfin, les analyses génétiques ont permis d’affiner la localisation de nombreux QTL et d’identifier plusieurs gènes candidats dont le gène RB1 connu pour être impliqué dans la différentiation des cellules musculaires et localisé dans un QTL régulant à la fois l’épaisseur de la longe et l’expression de deux gènes impliqués dans le métabolisme des acides gras et la différentiation des cellules adipogéniques.