État de conservation des habitats : propositions de définitions et de concepts pour l'évaluation à l'échelle d'un site Natura 2000

Depuis une vingtaine d’années, l’évaluation de l’état de conservation des habitats est devenue un élément important des plans de gestion d’espaces naturels. La transposition de la Directive Habitats-Faune-Flore (92/43/CEE) (DHFF) dans le code de l’environnement fournit un cadre réglementaire pour l’évaluer à l’échelle d’un site Natura 2000. Le Muséum national d’Histoire naturelle (MNHN) a été chargé de proposer des méthodes à l’intention des gestionnaires afin de standardiser les évaluations et produire un diagnostic utile à la gestion. En se centrant sur la notion d’habitat (terrestre et marin) et sur son évaluation, nous proposons dans cet article des définitions afin de combler certaines lacunes identifiées et de préciser le concept d’état de conservation. La nécessité de se situer dans le cadre d’une typologie est évoquée avec ses avantages et ses limites. En considérant l’habitat comme un système complexe selon les théories générales des systèmes, son état de conservation traduit l’état de ses composantes ainsi que de leurs interactions, entre elles et avec l’environnement. Évaluer l’état de conservation implique ainsi d’évaluer la structure, la composition et les fonctions d’un habitat, qui sont interdépendantes. La nécessité d’évaluer amène à faire des choix, il s’agit de définir « l’état optimal souhaité » comme objectif théorique à long terme, et « l’état favorable choisi » comme proposition de cible opérationnelle pour les gestionnaires. Ces choix de seuils doivent être éclairés par des éléments scientifiques, tout en s’insérant dans le contexte socio-économique et culturel pris en compte par la DHFF. Nous discutons également de l’influence de la dynamique des habitats sur la définition des états de conservation. Enfin, certains choix méthodologiques clés sont présentés, notamment la place des espèces dans l’évaluation des habitats et les liens possibles entre diagnostic et gestion